接着，第二次总攻开始了。在敌人强大而密集的火力下，红军付出较大伤亡之后，被迫后撤。
3 月7 日凌晨。红一师指挥所。夜色朦胧，晨星闪烁。黄克诚辗转反侧， 一点也睡不着，于是索性披衣坐了起来。黄克诚有个习惯，一到仗打得不顺的时候，就睡不着觉，心里总放心不下。特别是这些天来，红军攻城屡次受挫，伤亡日多，敌人援兵又有对红军分割包围之企图，黄克诚有一种不祥的预感：此次部队要遭受大的损失。因而，几天来他夜里睡觉都不安稳，时刻提防有什么险情出现，以便及时采取应变措施。突然间，枪声大作，撕裂夜空。
敌人乘夜出击了！黄克诚心里骤然一惊。连日来的围攻，使大家对敌人稍有松懈，哪里会想到敌人敢在夜里出击。黄克诚暗叫不好，赶紧去唤醒旁边的候中英：“喂，醒一醒！敌人好像向我们进攻了，快起来！”
候中英刚刚睡醒，还有点搞不清发生了什么事。黄克诚一把将他拖了起来。
枪声更加密集。
候中英这才被惊醒，急急忙忙跑出师部，去指挥部队应战。黄克诚待侯中英走后，稍加思索，立即命令通讯班转移，在另外一个比较隐蔽的地方架线，设立新的师指挥所。电线刚架好，黄克诚一把抓住电话筒，向军团部报告情况，并且建议：“情况十分紧急，应当下令立即撤退突围。”话筒那边立刻传来了邓萍参谋长的命令：“不准撤退！”黄克诚心中十分焦急，放眼望去，四周漆黑一片，枪声却越来越近了。
黄克诚判定红一师已经被敌人切割开来，处在十分危险的境地。于是，他不顾上级不准撤退的命令，断然采取机动措施：命令师直属部队后撤南门外，同时派人通知特务连做好一切应急准备。黄克诚随即带领通讯班离开临时指挥所，摸黑前进，寻找红一师的队伍。
行至中途，一个连政委率部慌慌张张跑了过来。“政委，敌人太多了，我们已经不行了。”那个连政委面露仓惶之色，向黄克诚报告。黄克诚看到他这副样子，忍不住心头火起，严厉地训斥了他一顿。
“就地抵抗，掩护指挥机关先撤！”黄克诚最后下令道。那个连政委这才收敛了惊慌失措之色，带领队伍就地展开，阻击敌人。
后来，黄克诚得知，那个连政委表现英勇，率领全连奋力阻击蜂拥而来的敌人，最后全连干部战士壮烈牺牲。
又摸索向前走了一段路后，黄克诚碰见了军团所属特务团的一个营。简短交谈过后，黄克诚才知道他们原本负责红二师与红三师之间的联络，一直守护在这里。黄克诚告诉营长姚喆，赶快后退，要不然只有白白送死。
姚喆面露难色：“我们没有接到军团部撤退命令，如果..”黄克诚断然应道：“你赶快带部队撤退，一切后果由我负责！”姚喆这才带领队伍撤退。
天色正黑，黄克诚带领通讯班径直前行，寻找被打散的部队。这时，他们早已搞不清方向。走着走着，一个战士眼尖，看见前面是一大片开阔地，隐约间有灯光闪烁，还有几个奇形怪状的东西。
他把情况告诉了黄克诚。黄克诚手扶眼镜框，仔细一看，原来是敌人的飞机场！黄克诚这才知道，他们误人了南门外敌人的飞机场，那几个奇形怪状的东西是飞机。他刚想带领大家后撤，机场守敌已经发现了他们，大声喝问：“哪一部分？”
“是一师的。”黄克诚不及思索，随口应道。
敌人误以为黄克诚他们是“十一师”的兄弟，也不再追问了。
黄克诚趁机率领通讯班穿越机场，来到了南门外。恰巧，侯中英师长也在这里，正在指挥一师队伍后撤。看到红一师大部平安撤退，黄克诚稍感放心。但是，其他兄弟部队不知道现在怎么样了？他叫住了侯中英：“我看是不是与红二师联系一下，看看他们撤了没有。如果没有，应该告诉他们赶快趁夜撤离。要不然，天色放亮，想突围也困难了。”
“这样也好，这事你去办吧。我还要到前边去，看看还有没有一师的部队。”候中英说完，带领一班人马，消失在夜幕中。黄克诚亲自赶赴红二师指挥所。
大色依旧漆黑一片，枪声一直未歇。红二师仍然坚守原地，没有撤离。
黄克诚疾跑而来，来不及喘息片刻，便向红二师师长郭炳生建议部队撤退。
郭炳生曾经是黄克诚的上级，他告诉黄克诚：“我们没有接到撤退的命令，不能后撤。”
黄克诚向郭炳生晓以利害：“现在我们已经被敌人分割包围，能够突围而出就是胜利，留下来只会是无谓的牺牲。天色快亮了，还不突围恐怕时间来不及了。”郭炳生坚持等候上级命令。黄克诚无可奈何，也不便再多说什么，便转向南门外，寻找侯中英和一师的队伍。
他还不知道，候中英返回一师驻地，敌人正从一师驻地方向源源而出。
原来，这次深夜突袭，赣州城内守敌挖了三条出击坑道。其中一条坑道正好挖到了红一师指挥部背后，城内守敌从坑道中出击偷袭，与城外援兵构成内外夹击之势。正因为如此，红军才被打乱分割。
候中英返回寻找失散队伍，便陷入了敌人重围之中，众寡悬殊，候中英被俘杀害。
黄克诚四处寻找侯中英，但不见踪影。这时，他发现四周都有敌人，有不少红军战士正在乱跑，看来红军指挥系统已经失灵了。他意识到自己正处在一种十分危险的境地。
稳住大家，有组织的撤离已经不现实，黄克诚带领通讯班战士立即钻进了临街的一家店铺，穿过店堂，直奔后窗。几个人打开后窗，跳了出去，一口气跑出南关外，一直跑到城南的山上，大家才停下来喘了口气。
收拢了山上一些零散部队后，黄克诚果断指挥部队组织抗击敌人。
激战中，中革军委主席朱德亲率警卫营和红五军团赶到，掩护攻城部队撤出了战斗。
3 月8 日，根据中革军委命令，红军从赣州撤围，移师赣县江口一带， 进行整训补充。
历时三十三大的赣州攻坚战宣告结束。赣州一役，红军伤亡很大，损失了三千多人。
赣州之役的实践证明，黄克诚依据战场情况提出的数次撤围建议都是正确的。在红军遭到突袭，腹背受敌的不利形势下，黄克诚在积极向上级报告的同时，果断下令部队立即撤退突围，是非常恰当的。故而，部队虽然没有接到命令撤退，但黄克诚的作法上级没有追究。
黄克诚是个勤于思考的人。赣州之役以后，他进行了深刻的反思：攻城之初，我军在数量上是占优势，红三军团参战部队这一万余人。但地形条件对我军十分不利。赣州城高且固，三面环水，坚城之下屯重兵，旷日持久地攻城，乃兵家之大忌。负责打援的红四军把主要力量放在南面，用来对付广东方面的援敌，没有料到敌人会从赣州以北吉安远道驰援。因此，未能在北面堵住援放。待敌人半夜里从城年打洞出击，我军没有准备，有些措手不及。临战于我十分不利的情况之下，又不准部队撤退突围，遂导致重大损失。江口休整期间，苏区中央政治局召开了扩大会议，总结了攻打赣州的经验教训，研究确定了今后中央红军行动方针。
3 月17 日，红军总政治部发出训令，指出赣州撤围后，“在江西红军应当扩大苏区，贯通赣江西岸的苏区，以赣江流域为中心，向北发展创造苏区，来包围赣江流域的几个中心城市赣州、吉安、樟树，以便利于我们迅速地夺取这些城市，这样来争取江西的首先胜利。”
“同时，派一部兵力人闽，开展闽西苏区，威胁粤军。各部应筹得充分给养，作长期革命战争经费，这样来筹备向闽发展，来争取赣州、吉安、抚州。”
（责任编辑：馨语）
